MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187127	GCA	2	6	67	72	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NT_187127	GAA	2	6	131	136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NT_187127	T	6	6	157	162	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NT_187127	GT	3	6	165	170	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NT_187127	AGCGC	2	10	198	207	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NT_187127	CCG	2	6	224	229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NT_187127	GCA	2	6	271	276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NT_187127	T	6	6	731	736	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NT_187127	TTCTA	2	10	743	752	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NT_187127	TCT	2	6	1808	1813	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NT_187127	T	6	6	1869	1874	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NT_187127	TCA	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NT_187127	ATTTA	2	10	1906	1915	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NT_187127	AATTA	2	10	1941	1950	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NT_187127	TTTTGA	2	12	1965	1976	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
16	NT_187127	AGT	2	6	1987	1992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NT_187127	TTCG	2	8	2028	2035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NT_187127	CAA	2	6	2056	2061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NT_187127	GAG	2	6	2063	2068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NT_187127	CAC	2	6	3680	3685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NT_187127	GTGG	2	8	8271	8278	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NT_187127	ACA	2	6	12084	12089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NT_187127	TCTT	2	8	12117	12124	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NT_187127	GAAG	2	8	12144	12151	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NT_187127	GGC	2	6	12175	12180	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NT_187127	CAG	2	6	12239	12244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NT_187127	TCA	2	6	14735	14740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NT_187127	TAA	2	6	14756	14761	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NT_187127	ATG	2	6	14801	14806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NT_187127	GAC	2	6	14844	14849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NT_187127	ATT	2	6	14904	14909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NT_187127	AG	3	6	15505	15510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NT_187127	TAC	2	6	16751	16756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NT_187127	GC	3	6	16775	16780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NT_187127	TGG	2	6	16815	16820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NT_187127	TGT	2	6	20975	20980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NT_187127	CAA	2	6	21016	21021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NT_187127	GGT	2	6	21028	21033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NT_187127	TAAC	2	8	21064	21071	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
40	NT_187127	TGT	2	6	21106	21111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NT_187127	GAG	2	6	21142	21147	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NT_187127	CCG	2	6	21217	21222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NT_187127	CCG	2	6	21242	21247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
44	NT_187127	CAGAA	2	10	22716	22725	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NT_187127	TAAA	2	8	22760	22767	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NT_187127	T	6	6	22806	22811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NT_187127	ATA	2	6	24796	24801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NT_187127	T	7	7	24825	24831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NT_187127	TTTG	2	8	24982	24989	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NT_187127	TTAA	2	8	24990	24997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NT_187127	CTT	2	6	25013	25018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NT_187127	CATT	2	8	25125	25132	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NT_187127	TAACCA	2	12	25406	25417	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NT_187127	ATAA	2	8	28992	28999	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NT_187127	A	6	6	28998	29003	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NT_187127	CGC	2	6	29043	29048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
57	NT_187127	A	7	7	29541	29547	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NT_187127	TTA	2	6	30537	30542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NT_187127	GCGCT	2	10	32146	32155	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NT_187127	GT	3	6	32169	32174	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NT_187127	GCC	2	6	32198	32203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
62	NT_187127	CCT	2	6	33660	33665	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NT_187127	A	6	6	33673	33678	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NT_187127	G	6	6	33682	33687	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NT_187127	GGA	2	6	33689	33694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NT_187127	CAT	2	6	33728	33733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NT_187127	A	7	7	34896	34902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NT_187127	TGA	2	6	36388	36393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NT_187127	GC	3	6	36447	36452	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NT_187127	GCA	2	6	37439	37444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NT_187127	T	7	7	37468	37474	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NT_187127	T	7	7	37497	37503	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NT_187127	C	6	6	37536	37541	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
74	NT_187127	CCG	2	6	41417	41422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NT_187127	GTA	2	6	41472	41477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NT_187127	TAA	2	6	41520	41525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NT_187127	TGT	2	6	41568	41573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NT_187127	TAA	2	6	41645	41650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NT_187127	T	6	6	42064	42069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NT_187127	TA	3	6	42104	42109	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NT_187127	TA	3	6	42125	42130	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NT_187127	GCGCT	2	10	42806	42815	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
83	NT_187127	GAT	2	6	42845	42850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NT_187127	CGC	2	6	42877	42882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NT_187127	TCGTT	2	10	42898	42907	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NT_187127	ATT	2	6	44306	44311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NT_187127	CAG	2	6	44320	44325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NT_187127	ATG	2	6	44372	44377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NT_187127	AGG	2	6	44615	44620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NT_187127	CCA	2	6	45913	45918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
91	NT_187127	CT	3	6	45970	45975	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NT_187127	GCC	2	6	45979	45984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NT_187127	GCT	2	6	46564	46569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NT_187127	AT	3	6	46596	46601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NT_187127	AAC	2	6	46662	46667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NT_187127	GGA	2	6	46725	46730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NT_187127	ATA	2	6	46744	46749	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NT_187127	T	6	6	48132	48137	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NT_187127	TTAT	2	8	48148	48155	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NT_187127	TA	3	6	49221	49226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NT_187127	T	6	6	49250	49255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NT_187127	GCC	2	6	49292	49297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NT_187127	ATT	2	6	49627	49632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NT_187127	TACA	2	8	49679	49686	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NT_187127	A	7	7	49694	49700	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NT_187127	TCC	2	6	50731	50736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
107	NT_187127	GCGCTT	2	12	53338	53349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NT_187127	CGC	2	6	53396	53401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
109	NT_187127	CCA	2	6	53421	53426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NT_187127	TCT	2	6	53441	53446	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NT_187127	TGT	2	6	54745	54750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NT_187127	ATC	2	6	54752	54757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NT_187127	T	6	6	54761	54766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NT_187127	TCCT	2	8	54787	54794	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NT_187127	T	6	6	54826	54831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NT_187127	TAA	2	6	54848	54853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NT_187127	T	6	6	55623	55628	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NT_187127	TGC	2	6	55679	55684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
119	NT_187127	GTTT	2	8	55701	55708	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NT_187127	AGGA	2	8	55711	55718	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NT_187127	GGC	2	6	57317	57322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NT_187127	ATG	2	6	57374	57379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NT_187127	GCG	2	6	57402	57407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NT_187127	GTTT	2	8	60271	60278	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
125	NT_187127	CAA	2	6	60367	60372	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NT_187127	CG	3	6	60382	60387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NT_187127	GAC	3	9	60998	61006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NT_187127	A	6	6	61027	61032	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NT_187127	CTG	2	6	61070	61075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NT_187127	TAT	2	6	61112	61117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NT_187127	A	6	6	61136	61141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NT_187127	CAT	2	6	61202	61207	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NT_187127	AT	3	6	61284	61289	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NT_187127	T	6	6	61302	61307	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NT_187127	ACA	2	6	61309	61314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NT_187127	TAT	2	6	61351	61356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NT_187127	TTAA	2	8	61363	61370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NT_187127	TGA	2	6	61388	61393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NT_187127	TTA	2	6	61618	61623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NT_187127	CGG	2	6	61711	61716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
141	NT_187127	TGA	2	6	61732	61737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
142	NT_187127	T	6	6	61741	61746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NT_187127	TAT	2	6	61776	61781	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NT_187127	TAGT	2	8	61793	61800	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NT_187127	AAT	2	6	61803	61808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NT_187127	A	6	6	61825	61830	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NT_187127	TTAA	2	8	61843	61850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NT_187127	TGT	2	6	61863	61868	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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473	NT_187127	AG	3	6	185508	185513	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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